Tại hội nghị lần này, Ban Chấp hành Trung ương Đảng tập trung thảo luận, ban hành Quy chế làm việc của Ban Chấp hành Trung ương, Bộ Chính trị, Ban Bí thư và Ủy ban Kiểm tra Trung ương; quy định thi hành Điều lệ Đảng, quy định về công tác kiểm tra, giám sát và kỷ luật của Đảng; đặc biệt là giới thiệu nhân sự lãnh đạo cấp cao của các cơ quan nhà nước nhiệm kỳ 2016-2021 và một số nội dung quan trọng khác.
Những nội dung nêu trên đều là những vấn đề rất cơ bản và hệ trọng, tác động trực tiếp đến kết quả triển khai thực hiện Nghị quyết Đại hội XII của Đảng; giữ vững vị trí, vai trò, sự lãnh đạo của Đảng; củng cố, xây dựng lòng tin của nhân dân đối với Đảng; thực hiện đổi mới phong cách, nâng cao năng lực lãnh đạo, sức chiến đấu của Đảng...
Với tinh thần dân chủ, trách nhiệm chính trị, phát huy cao nhất khả năng sáng tạo độc lập của từng đại biểu, Ban Chấp hành Trung ương Đảng đã thảo luận, xem xét sâu, kỹ từng vấn đề theo chương trình hội nghị đề ra. Trong từng vấn đề, Ban Chấp hành Trung ương đều phân tích, nêu bật những kết quả đã làm được; thẳng thắn chỉ rõ những hạn chế, khuyết điểm, xác định cụ thể nguyên nhân của từng hạn chế, khuyết điểm gắn với trách nhiệm của từng cấp, từng ngành, từng cá nhân, nhất là người đứng đầu cấp ủy, cơ quan, đơn vị, địa phương. Thông qua thảo luận sâu sắc từng vấn đề, không chỉ tiếp tục góp phần nâng cao nhận thức, thể hiện quyết tâm chính trị của Ban Chấp hành Trung ương, Bộ Chính trị, Ban Bí thư; mà còn thể hiện tinh thần đoàn kết, hạt nhân lãnh đạo đưa đất nước vượt qua những khó khăn, thử thách vững bước phát triển. Đặc biệt, việc Trung ương thận trọng xem xét, lựa chọn, giới thiệu nhân sự lãnh đạo cấp cao của các cơ quan Nhà nước nhiệm kỳ 2016-2021 thể hiện quyết tâm chính trị cao của Ban Chấp hành Trung ương trong lãnh đạo, chỉ đạo, xây dựng đội ngũ cán bộ, nâng cao chất lượng, hiệu quả hoạt động của bộ máy Nhà nước; đẩy mạnh công tác phòng, chống tham nhũng, lãng phí.
Với những bước phát triển vững chắc của đất nước, từ thực tiễn và kinh nghiệm đạt được sau 30 năm thực hiện đường lối đổi mới; trước những biến đổi mau lẹ của tình hình thế giới, khu vực, những nội dung được Trung ương thảo luận, cho ý kiến tại hội nghị lần này là bước cụ thể hóa cơ chế lãnh đạo, hoàn thiện mô hình phát triển; tạo ra những giá trị bền vững; xác định khâu then chốt tạo đà để phát triển đất nước với phương châm: Độc lập dân tộc gắn liền với chủ nghĩa xã hội và mục tiêu xuyên suốt: Dân giàu, nước mạnh, dân chủ, công bằng, văn minh.
Nắm vững nội dung, chủ động triển khai thực hiện hiệu quả nghị quyết và các kết luận của Hội nghị Trung ương 3 (khóa XII) vừa là yêu cầu, vừa là nhiệm vụ chính trị của mỗi tổ chức đảng, của từng đảng viên, của cả hệ thống chính trị và của mọi người dân. Đặc biệt, từng cán bộ, đảng viên phải nhận thức sâu sắc các nhiệm vụ, giải pháp, nhanh chóng triển khai thực hiện thắng lợi Nghị quyết Đại hội XII của Đảng. Thực hiện hiệu quả Nghị quyết Trung ương 3 (khóa XII) không những có ý nghĩa tiếp nối sức mạnh của dân tộc, kế thừa và phát huy đầy đủ thành tựu 30 năm đổi mới, mà chính là điều kiện để đẩy mạnh hội nhập quốc tế, tận dụng tốt thời cơ, nâng cao vị thế Việt Nam trên trường quốc tế, thúc đẩy đất nước phát triển.
Để thực hiện hiệu quả Nghị quyết Trung ương 3 (khóa XII), từng cấp ủy Đảng từ Trung ương đến cơ sở cần chuẩn bị thật đầy đủ, kỹ lưỡng cả về trí lực và vật lực; lường trước những khó khăn, thách thức đặt ra để mỗi cấp, mỗi ngành, mỗi lực lượng và từng người dân chủ động đóng góp công sức, trí tuệ xây dựng đất nước, mà trên hết, trước hết là tập trung lãnh đạo, thực hiện tốt các mục tiêu, nhiệm vụ phát triển kinh tế-xã hội 6 tháng cuối năm và cả năm 2016. Quán triệt, vận dụng sáng tạo Quy chế làm việc của Ban Chấp hành Trung ương, Bộ Chính trị, Ban Bí thư và Ủy ban Kiểm tra Trung ương; quy định thi hành Điều lệ Đảng, quy định về công tác kiểm tra, giám sát và kỷ luật của Đảng, xác định rõ thẩm quyền, trách nhiệm của cấp ủy, tổ chức Đảng, nhất là người đứng đầu trong thực hiện nhiệm vụ ở từng cấp, từng ngành, từng địa phương; đặc biệt là phương pháp, cách thức lựa chọn, giới thiệu nhân sự lãnh đạo cấp cao, thực chất chính là những nội dung trọng tâm về xây dựng đội ngũ cán bộ; là bước cụ thể hóa chủ trương, quan điểm của Đảng vào thực tiễn cuộc sống. Thực hiện hiệu quả những nội dung trọng tâm nêu trên là cơ sở quan trọng, có ý nghĩa quyết định xây dựng Đảng ta thực sự trở thành một tổ chức cách mạng, chặt chẽ, kỷ cương, đoàn kết, thống nhất cao.
Với tinh thần kiên quyết và triệt để, với truyền thống và bản chất tốt đẹp Bộ đội Cụ Hồ, mỗi cán bộ, đảng viên, quần chúng trong Đảng bộ Quân đội nghiêm túc quán triệt, chủ động thực hiện nghị quyết và các kết luận của Hội nghị Trung ương 3 (khóa XII) đạt hiệu quả thiết thực; đóng góp xứng đáng công sức, trí tuệ xây dựng và bảo vệ Tổ quốc Việt Nam xã hội chủ nghĩa; xứng đáng là lực lượng chính trị, lực lượng chiến đấu trung thành, tin cậy của Đảng, Nhà nước và nhân dân.
QĐND